CentreStack intègre un ensemble de fonctionnalités de sécurité telles que des rapports d'audit, des journaux de modification de fichiers, des heuristiques pour bloquer les appareils qui modifient les fichiers trop fréquemment, et un chiffrement de bout en bout. Ces fonctionnalités sont conformes à des normes telles que le RGPD et l'HIPAA, ce qui le rend idéal pour les industries nécessitant une sécurité des données et une conformité rigoureuses.