Pilvitallennuksen salaus toimii salaamalla tiedot siirron aikana ja levossa ollessa, varmistaen että tiedot ovat turvallisia ja säännösten, kuten HIPAA:n, mukaisia. Tämä prosessi sisältää tiedot-levossa-salauksen käyttämisen siirron aikana ja paikallisen välimuistin salaamisen paikallisissa laitteissa, sekä S3:ssa tallennettujen tietojen salaamisen.